Základy farmakogenomiky

Internetové zdroje


  1. Databáze sekvencí nukleotidů a proteinů
  2. Vyhledávání sekvencí
  3. Ostatní služby
  4. Zajímavé internetové odkazy s farmakogenomickou tématikou

(prezentace: .ppt (155 kB), .odp (69,3 kB))

1. Databáze sekvencí nukleotidů a proteinů



1.1. Univerzální databáze
Rozvoj technik sekvencování vyústil v založení několika nezávislých databází, z nichž nejvýznamnější jsou:

  1. Databáze EMBL, založená v roce 1980 při Evropském institutu pro bioinformatiku ve Velké Británii (EBI), http://www.ebi.ac.uk
  2. Databáze GenBank, založená v roce 1982 při Národním centru pro biotechnologické informace („National Center for Biotechnology Information“, NCBI) založené v rámci Národní lékařské knihovny (NLM) v USA, http://www.ncbi.nlm.nih.gov
  3. Databáze DDBJ, založená v roce 1984 při Centrum pro inormační biologii (CIB) , jako oddělení Národního genetického institutu (NIG) v Japonsku, http://www.cib.nig.ac.jp


V současné době jsou všechny tyto databáze propojeny a vzájemně si vyměňují informace, existuje tedy jednotná databáze všech nukleotidových sekvencí (GenBank/EMBL/DDBJ). Jsou do ní přijímány data ze všech projektů sekvencování od institucí i jednotlivců z celého světa. Databáze je veřejně přístupná a slouží jako záklaní kámen pro výzkum v oblasti bioinformatiky. Kromě vlastních dat obsahuje softwarové nástroje pro analýzu sekvencí a slouží obecně k rozšiřování biomedicínckých informací pro lepší porozumění molekulárních procesů ovlivňujících lidské zdraví a nemoci.




Pro zobrazení další části se musíte přihlásit



Projekt byl vytvořen za finanční­ podpory Fondu rozvoje vysokých škol FRVŠ .
XHTML 1.0 Valid, CSS 2.1 Valid